民事诉讼案件立案后撤案，被告在一定情形下可以启动刑事诉讼。但需要满足刑事诉讼的相关条件和标准，关键在于是否存在符合刑事立案标准的犯罪事实以及是否有证据支持。
民事诉讼和刑事诉讼是两种不同性质的诉讼程序。民事诉讼主要是解决平等主体之间的人身关系和财产关系纠纷，而刑事诉讼是为了追究犯罪嫌疑人的刑事责任，维护社会秩序和公共利益。当民事诉讼立案后撤案时，如果被告发现存在可能涉及犯罪的情况，是有可能启动刑事诉讼的。
从启动条件来看，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，任何单位和个人发现有犯罪事实或者犯罪嫌疑人，有权利也有义务向公安机关、人民检察院或者人民法院报案或者举报。如果被告掌握了相关证据，能够证明存在犯罪行为，比如原告在民事诉讼过程中存在诈骗、伪证等犯罪行为，那么被告可以向相关司法机关报案。例如，在一些合同纠纷的民事诉讼中，原告可能通过伪造合同关键条款来骗取被告财物，若被告在后续发现了原告伪造证据的行为，就可以向公安机关报案，启动刑事诉讼程序。
司法机关是否会立案受理并启动刑事诉讼，取决于是否有犯罪事实需要追究刑事责任。司法机关会对被告提供的报案材料进行审查，判断是否符合刑事立案的标准。如果经过审查，认为没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微，不需要追究刑事责任的，司法机关将不予立案。并且，不同类型的犯罪有不同的构成要件和立案标准，被告需要提供足够的证据来证明这些构成要件的存在。
综上所述，民事诉讼案件立案后撤案，被告在发现符合刑事立案标准的犯罪事实且有相应证据时，可以通过向司法机关报案等方式启动刑事诉讼，但最终是否能成功启动以及追究刑事责任，要由司法机关根据具体情况进行判断和处理。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》 第二条
中华人民共和国民事诉讼法的任务，是保护当事人行使诉讼权利，保证人民法院查明事实，分清是非，正确适用法律，及时审理民事案件，确认民事权利义务关系，制裁民事违法行为，保护当事人的合法权益，教育公民自觉遵守法律，维护社会秩序、经济秩序，保障社会主义建设事业顺利进行。
《中华人民共和国刑事诉讼法》 第二条
中华人民共和国刑事诉讼法的任务，是保证准确、及时地查明犯罪事实，正确应用法律，惩罚犯罪分子，保障无罪的人不受刑事追究，教育公民自觉遵守法律，积极同犯罪行为作斗争，维护社会主义法制，尊重和保障人权，保护公民的人身权利、财产权利、民主权利和其他权利，保障社会主义建设事业的顺利进行。
