相对不起诉不会留下案底。
相对不起诉是人民检察院对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，作出的不起诉决定。因为相对不起诉意味着犯罪嫌疑人的行为虽然构成犯罪，但情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪或者依法不需要判处刑罚。
案底通常指的是某人过去犯罪行为的记录。而相对不起诉并未对犯罪嫌疑人定罪判刑，也就不符合形成案底的条件。
从法律性质和后果来看，相对不起诉是检察机关在审查起诉阶段的一种处理方式，其目的在于合理运用司法资源，实现法律效果和社会效果的统一。被相对不起诉的人在法律上没有被认定为罪犯，其各项权利和正常公民一样受到法律的保护。
需要注意的是，虽然相对不起诉不会留案底，但这一决定并不意味着行为本身没有违法性，只是在综合考虑各种因素后，作出了相对宽缓的处理。
法律依据：
《刑事诉讼法》第十六条 有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（二）犯罪已过追诉时效期限的；
（三）经特赦令免除刑罚的；
（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。
