员工卷款逃跑的立案标准通常与卷款的金额、行为的性质以及造成的后果等因素相关。
一般来说，如果卷款金额达到三千元至一万元以上，可能会被以盗窃罪立案。在一些地区，这个标准可能会有所不同。
如果员工利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额在五千元至一万元以上的，可能构成职务侵占罪，会被立案。
需要注意的是，除了金额，行为的情节和后果也会影响是否立案。比如，即使卷款金额未达到上述标准，但卷款行为导致公司经营困难、造成严重社会影响等，也可能会被立案。
此外，立案标准还会受到法律规定的调整和当地司法实践的具体情况影响。具体的立案标准应以当地的法律法规和司法机关的判断为准。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》第二百七十一条 公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
