在强奸罪中，违背妇女意志的认定通常需要综合多方面的因素进行判断。
1、被害人的反抗表现。包括身体上的强烈反抗，如挣扎、搏斗、呼喊等；或者言语上的明确拒绝和反抗。但需要注意的是，没有明显的反抗表现并不意味着同意，因为可能存在被害人因恐惧、受到威胁等而不敢反抗的情况。
2、案发时的环境和条件。比如，案发地点是否偏僻、封闭，是否存在使被害人感到难以求助或无法逃脱的情况。
3、双方的关系。如果双方是陌生人或者关系较为疏远，违背意志的可能性相对较大；但如果是熟人关系，也要具体分析当时的具体情况。
4、行为人的手段。使用暴力、胁迫或者其他使妇女不能反抗、不敢反抗、不知反抗的手段，如殴打、捆绑、恐吓、麻醉等。
5、被害人的陈述。被害人对案发经过的陈述是重要的证据之一，但需要结合其他证据进行综合判断，防止出现虚假陈述。
6、物证和证人证言。例如现场留下的打斗痕迹、衣物破损、证人听到的异常声音等。
7、行为人的供述。行为人的供述也是判断是否违背妇女意志的参考因素之一，但同样需要与其他证据相互印证。
总之，对于是否违背妇女意志的认定，需要综合全案的证据和具体情况，进行客观、全面、准确的判断，不能仅凭某一方面的证据就轻易下结论。
法律依据：
《刑法》第二百三十六条 以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。
奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。
强奸妇女、奸淫幼女，有下列情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑：
（一）强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的；
（二）强奸妇女、奸淫幼女多人的；
（三）在公共场所当众强奸妇女的；
（四）二人以上轮奸的；
（五）致使被害人重伤、死亡或者造成其他严重后果的。
